Master 2 bio-informatique - parcours type : développement logiciel et analyse des données (dlad)

Certification : Master bioinformatique (fiche nationale)

Proposée par UNIVERSITE AIX MARSEILLE AMU — 13000 Marseille

Formation Professionnelle Apprentissage
RNCP 38964
Présentiel
Apprentissage envisageable

Type

Catégorie de la certification

Master

Niveau de sortie

Niveau reconnu si applicable

Bac +5 (Niveau 7 - équivalence européenne)

Prix

Indiqué par l'établissement

5 600 €

Présentation

Ce parcours mène aux métiers de bioinformaticien.ne-développeur.euse et de bioinformaticien.ne-analyste.

Formation dispensée en Présentiel à l'adresse suivante :

Localisation & Rattachements

Adresse
3 Place Victor Hugo 13000 Marseille
Académie
Aix-Marseille
Département
Bouches-du-Rhône
Région
Provence-Alpes-Côte d'Azur

La carte est indicative. Vérifiez l’accès avant votre déplacement.

Objectifs

Les étudiants acquerront une formation interdisciplinaire en biologie, informatique et statistique. Les applications biologiques incluront l'analyse de données génomiques, épigénomiques, transcriptomiques et protéomiques, évolutives, et des variations polymorphiques. La formation en informatique s'appuiera sur des cours de programmation, administration de systèmes, ingénierie logicielle, une formation aux bonnes pratiques pour la reproductibilité des résultats scientifiques, le développement de ressources bioinformatiques (bases de données, outils d'analyse) et le déploiement d'interfaces pour ces ressources. Les biostatistiques couvriront inférence statistique, analyse de données multidimensionnelles, modélisation des séquences et apprentissage automatique.

Débouchés / Résultats attendus

  • Développer une approche pluridisciplinaire qui intègre les concepts et méthodes de biologie, d'informatique, de mathématiques et statistiques afin de décrypter les mécanismes présidant au fonctionnement et à l'évolution du vivant. Ceci inclura :
  • savoir analyser des données génomiques de différentes nature pour en extraire l'information pertinente, et interpréter les résultats en termes de mécanismes biologiques ou d'applications (médecine, agriculture, biotechnologie) ;
  • savoir élaborer des procédures reproductibles pour l'analyse analyses de données massives (“workflows”) ;
  • savoir développer un outil informatique original suivant les bonnes pratiques du domaine (programmation collaborative, gestion des versions, documentation du code et des modes d'utilisation) ;
  • s'exprimer et produire des rapports scientifiques en anglais.

Programme & Référentiel

Semestre 3

  • Bibliographic review in preparation to the Master thesis (3 crédits)
  • Compléments de mathématiques et statistiques pour la bioinformatique (6 crédits)
  • Biological interaction networks (3 crédits)
  • Programmation avancée (6 crédits)
  • Programmation web: complément (3 crédits)
  • Génomique comparative et évolutive (3 crédits)
  • Analyses statistiques et bio-informatique des variations génomiques (3 crédits)
  • Professionnalisation 3 (3 crédits)

Semestre 4

  • Stage de M2 (30 crédits)